Природоохранная оценка объектов по критериям ценности, значимости и эффективности дает информацию для оптимизации использования и управления ими, что является одной из задач национального водного хозяйства. Предлагаемые методикой компоненты и составляющие природных экосистем отражают степень их репрезентативности, контрастности с окружением и текущее состояние. Для водных объектов показатель «обеспечение запасов воды и ее качества» стоит рассматривать отдельными позициями: «обеспечение запасов воды» и «качество воды». Динамика природных экосистем, обуславливающих данную услугу, может соответствовать оптимальным параметрам, либо иметь отклонения от них. Предлагаемая модификация методики рассмотрена на примере водного объекта - озеро Телецкое.