Качественное проведение аудиторской проверки позволяет в системе экономической безопасности максимизировать функцию полезности двух служб, а именно службы экономической безопасности и внутреннего аудита. Согласованность действий этих двух субъектов способна нивелировать как внешние, так и внутренние угрозы, а также добиться минимизации затрат, а, следовательно, укрепления финансовой независимости. Аудит позволяет выявить ошибки и искажения в отчетности организации, провести подробный анализ и сделать на его основании выводы, которые позволят получить и предоставить те факторы, которые необходимы для оптимизации экономической системы в целом. В данной статье рассмотрены некоторые угрозы, связанные с внешним и внутренним аудитом, а также предложены меры по их устранению, определено место аудита в системе экономической безопасности и структуре субъекта правоотношения, представлены способы повышения эффективности проведения методики аудиторской проверки.