Оценочная экспертиза, как отдельный вид таможенной экспертизы, является важным инструментом, обеспечивающим реализацию процесса таможенного контроля. В статье рассмотрены проблемы регулирования оценочной деятельности таможенных органов в российском законодательстве. Автор статьи проводит сопоставление правовых и методических аспектов проведения «судебной оценочной экспертизы» и «таможенной оценочной экспертизы» в рамках проведение таможенного контроля. Также автор в статье рассматривает генезис, задачи и правовые проблемы оценочной экспертизы в таможенных органах. Это требуется для установления основных направлений развития оценочной экспертизы в российской системе. На основе проведенного анализа исследователь приходит к заключению о том, что в системе российского законодательства необходимо установить единые термины и определения и создать унифицированный понятийный аппарат для оценочной экспертизы в таможенных органах. Вместе с этим дополнить классификатор экспертных специализаций во всех подразделениях ЦЭКТУ новым видом таможенной экспертизы - «оценочная экспертиза» и разработать по аналогии федеральных стандартов оценки (ФСО) подробные инструкции путем определения рыночной стоимости товаров для экспертов-оценщиков в таможенных органах.